ДНК секвениране | Дезоксирибонуклеинова киселина - ДНК

ДНК секвениране

При секвенирането на ДНК се използват биохимични методи за определяне на последователността на нуклеотидите (молекула на ДНК основа със захар и фосфат) в молекула на ДНК. Най-широко използваният метод е методът за прекратяване на веригата на Sanger. Тъй като ДНК е съставена от четири различни основи, се правят четири различни подхода.

Всеки подход съдържа ДНК, която трябва да бъде секвенирана, праймер (изходна молекула за секвениране), ДНК полимераза (ензим, който разширява ДНК) и смес от всичките четири необходими нуклеотида. Въпреки това, във всеки от тези четири подхода различна основа е химически модифицирана по такъв начин, че да може да бъде включена, но не осигурява точка на действие за ДНК полимеразата. Това след това води до прекратяване на веригата. Този метод дава ДНК фрагменти с различна дължина, които след това се разделят химически чрез така наречената гел електрофореза според дължината им. Полученото сортиране може да бъде преобразувано в последователността от нуклеотиди в секвенираната ДНК секция чрез маркиране на всяка база с различен флуоресцентен цвят.

ДНК хибридизация

ДНК хибридизацията е молекулярно генетичен метод, използван за доказване на сходството между две единични вериги ДНК с различен произход. Този метод използва факта, че ДНК двойната верига винаги е съставена от две допълващи се единични вериги. Колкото по-сходни са двете единични вериги една с друга, толкова повече основи образуват твърда връзка (водородни връзки) с противоположната основа или се образуват повече двойки основи.

Няма да възникнат сдвоявания на основи между участъци на двете ДНК вериги, които имат различна база последователност. Относителният брой съединения вече може да се определи чрез определяне на точката на топене, при която новообразуваната двойна верига на ДНК се отделя. Колкото по-висока е точката на топене, толкова по-допълващи се основи са образували водородни връзки помежду си и толкова по-близки са двете единични вериги. Този метод може да се използва и за откриване на специфична основна последователност в ДНК смес, За тази цел изкуствено образуваните ДНК фрагменти могат да бъдат маркирани с (флуоресцентно) багрило. След това те служат за маркиране на съответната базова последователност и по този начин могат да я направят видима.