Диагнозата на хипотиреоидизъм се прави предимно от клиничната картина и лабораторното изследване.
По избор диагностика на медицински изделия-в зависимост от резултатите от историята, физическо изследване, лабораторна диагностика, и задължително диагностика на медицински изделия-използват се за диференциална диагноза.
- Ултрасонография на щитовидната жлеза (ултразвук на щитовидната жлеза) - за визуализиране на размера на щитовидната жлеза и за откриване на всякакви възли [често Тиреоидит на Хашимото: намален щитовидната жлеза със сонографски хомогенен, с ниско ехо отклонен модел].
- Сцинтиграфия на щитовидната жлеза (изображения на щитовидната жлеза и неговата функция при използване на радиоактивни вещества) - при съмнение за метаболитно активни възли.
- Фина игла биопсия (вземане на проби от тъкани със сонография) - в случай на аномалии в сцинтиграфия на щитовидната жлеза.