Следват най-важните заболявания или усложнения, за които може да допринесе болестта на Whipple:
Очи и очни придатъци (H00-H59).
Сърдечно-съдова система (I00-I99)
- ендокардит (ендокардиално възпаление; второ най-често място).
- миокардит (възпаление на сърце мускул).
- перикардит (възпаление на перикард) с клапна недостатъчност.
Мускулно-скелетна система и съединителната тъкан (M00-M99).
- полиартрит (възпаление на множество ставите).
- Синовиалит (възпаление на синовиалната мембрана)
Психика - нервна система (F00-F99; G00-G99)
- Амнезия (загуба на паметта)
- Атаксия (нарушение на походката)
- Парализа на погледа
- деменция
- Епилепсия (припадъци)
- Нарушен ритъм сън-събуждане
Симптоми и необичайни клинични и лабораторни находки, които не са класифицирани другаде (R00-R99).
- плеврит (плеврит).