Класификация според ензимната структура
Почти всички ензими сте протеини и могат да бъдат класифицирани според дължината на протеиновата верига: Освен това има отделни протеинови вериги, които съдържат няколко ензимни активности, те се наричат многофункционални ензими.
- Мономерни ензими, състоящи се само от една протеинова верига
- Олигомерни ензими, състоящи се от няколко протеинови вериги (мономери)
- Мултиензимни вериги Няколко ензими които си сътрудничат и се регулират взаимно. Тези ензимни вериги катализират последователните стъпки в метаболизма на клетката.
Класификация по кофактори
Допълнителна класификация е класификацията след разглеждане на кофакторите. Кофактори, коензими и ко-субстрати са имена за различни класификации на вещества, които влияят на биохимичните реакции чрез взаимодействието им с ензими. Разглеждат се органични молекули, а също и йони (предимно метални йони).
Чистите протеинови ензими се състоят изключително от протеини и активният център се формира само от аминокиселинни остатъци и пептидния скелет. Аминокиселините са клас органични съединения с поне една карбокси група (-COOH) и една амино група (-NH2). Холоензимите се състоят от протеинова част, апоензим, и кофактор, нискомолекулна молекула (без протеин).
И двете заедно са важни за функцията на ензима. Коензими Органичните молекули като кофактори се наричат коензими. Ако те са ковалентно свързани с апоензима, те се наричат протетични групи или ко-субстрат.
Протезната група е непротеинов компонент, който е здраво (обикновено ковалентно) свързан с протеин и има каталитичен ефект. Косубстратите са имената на различни класификации на вещества, които влияят върху биохимичните реакции чрез взаимодействието им с ензимите. Като биокатализатори, молекули, които ускоряват реакциите в организмите, ензимите ускоряват биохимичните реакции. Те намаляват енергията на активиране, която трябва да бъде преодоляна, за да може веществото да се преобразува.
